Le port d'Elounda accueille des charters privés depuis plus d'un siècle, d'abord comme port de pêcheurs d'éponges, puis comme point de ravitaillement pour la colonie de lépreux de Spinalonga. Aujourd'hui, les mêmes anneaux d'amarrage servent à une flotte de voiliers et de yachts à moteur qui transportent les visiteurs à travers les 170 kilomètres carrés d'eaux égéennes de la baie de Mirabello, devant des îlots qui abritaient des camps de pêche minoens et des tours de guet vénitiennes. La courbe orientale de la baie abrite Spinalonga, une île fortifiée dont les remparts s'élèvent à trente mètres au-dessus du niveau de la mer — construits en 1579 pour protéger les marais salants d'Elounda, puis réutilisés comme dernière colonie de lépreux active en Europe jusqu'en 1957. Les rues escarpées et les arcades de l'île sont restées intactes, et le droit d'entrée de 20 € soutient les travaux de conservation qui ont stabilisé les murs d'enceinte et les citernes couvertes. La plupart des départs quittent le port d'Elounda entre 09:00 et 11:00, lorsque les vents du nord-ouest sont inférieurs à dix nœuds et que l'angle du soleil favorise la photographie des bastions de Spinalonga. Les charters avec équipage proposent des sorties allant de la demi-journée vers l'île de Dia — une réserve naturelle inhabitée située à seize milles marins au nord-ouest — jusqu'aux circuits d'une journée complète qui sillonnent les criques calcaires de la péninsule de Kolokytha, où la profondeur passe de trois à trente mètres sur la longueur d'un bateau. Des phoques moines de Méditerranée patrouillent dans la partie extérieure de la baie ; les observations se concentrent autour de l'aube et en fin d'après-midi, bien que la population reste en danger critique d'extinction et que les rencontres ne soient jamais garanties. Les capitaines possèdent des licences de navigation commerciale délivrées par les garde-côtes helléniques et disposent de radios VHF réglées sur le canal seize ; la plupart des navires sont assurés auprès des clubs P&I grecs et répondent aux normes de la directive relative aux bateaux de plaisance. L'eau elle-même est l'attrait principal. La salinité de la baie de Mirabello oscille autour de 39 pour mille — plus élevée que dans l'Adriatique, inférieure à celle du bassin levantin — et la visibilité dépasse régulièrement vingt-cinq mètres dans le chenal ouvert. Les sites de plongée en apnée le long de la côte de Kolokytha révèlent des herbiers de Posidonia oceanica, un habitat prioritaire de l'UNESCO qui abrite de jeunes dorades et des poulpes. Les opérateurs d'excursions privées en bateau à Elounda travaillent sur une saison étroite : d'avril à octobre, lorsque la température de la mer passe de 16°C à 26°C et que les vents de meltémi — des vents du nord égéens qui soufflent jusqu'à trente nœuds en juillet et août — se calment en fin de matinée. Les plus grands yachts avec équipage disposent d'auvents d'ombrage, de douches d'eau douce et de cuisines à bord qui préparent des fruits de mer grillés ou des plateaux de meze provenant du marché d'Agios Nikolaos, à quatorze kilomètres au sud. Les semi-rigides plus petits et les caïques traditionnels privilégient la vitesse et la maniabilité, réduisant le temps de trajet vers Spinalonga de quarante minutes à la voile à dix-huit minutes à vitesse de déjaugeage. Tous les départs de charters nécessitent une réservation soixante-douze heures à l'avance pendant les semaines de pointe en juillet, bien que des disponibilités sans réservation apparaissent en mai et septembre lorsque le taux d'occupation des hôtels à Elounda chute en dessous de soixante pour cent.